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Este exame é indicado para casos em que já foi realizado o cariótipo de sangue periférico e foram encontrados translocações, deleções ou pedaços a mais de um cromossomo que se queira identificar.

São aplicados oito conjuntos de sondas a cromossomos obtidos por cultura de linfócitos ou qualquer outro tecido. É de importância crucial para se estabelecer o material translocado e que se encontra em trissomia, permitindo o correto diagnóstico e prognóstico do paciente.